1937 yılında, İkinci Dünya Savaşı patlak vermeden hemen önce Japon İmparatorluk Ordusu’nda görevli Yarbay Yuuki tarafından kurulan “D Agency”,  gizli bir ajan birimidir. D Agency, Japon askeri personeli içerisinde geniş bir ağa sahip olup bunlar arasından ajan seçmektedir. Yuuki, D Agency için IJA doktrinine karşı bir prensip belirlemiştir: “Öldürme, ölme ve yakalanma.” Yuuki, bu ilke doğrultusunda yurt içi ve yurt dışı güçlere karşı görevlere çıkan özel bir ajan ekibini eğitmektedir.